部分省市在市、县区一级成立的“城乡环境综合治理办公室”，是为了监督、管理城乡环境综合整治工作，成立的政府直属事业机构。

从承担的职能和行政机构的设置来看，城乡环境综合治理办公室和城管局职能重合，机构相似，都是承担城乡环境整治工作。相对而言，城乡环境综合治理办公室职能更偏向宏观管理和监督，而且包括了乡村环境综合整治工作。城管局则更偏向承担具体业务，包括绿化、美化、市容市貌、园林、市政设施管理等工作，城管局在乡镇一级的职能发挥，已经涵盖了小城镇街道、道路环境整治，通过职能延伸，也可以覆盖到乡村一级。

因此，在机关事业单位改革中，按照综合设置、职能整合的原则，职责相近的领域，机构整合设置，城乡环境综合治理办公室的职责，完成可以整合到城管局承担，监督管理职能由城管局机关承担。不设城管局的市县，由城管综合执法中心承担。其他职能由市县乡镇政府、交通、生态环境、民政等部门，按职能分工，承担相应的职能。

机构整合后，城乡环境综合治理办公室的工作人员，可以连人带编划转到城管局，或者分流到其他事业单位。